О святом Иоанне Зихнийском сохранилось немного сведений. Он жил в правление византийских императоров Андроника II (1282-1328 гг.) и Андроника III (1328-1341 гг.) Палеологов. В возрасте двух лет ребенок остался без родителей. Опеку над мальчиком взял его дядя монах Иннокентий, воспитавший будущего святителя согласно Евангельским заповедям.

По достижении соответствующего возраста Иоанн был рукоположен во священника. Добродетельная жизнь святого послужила его избранию на Зихнийскую епископскую кафедру.

После смерти дяди, святитель Иоанн ушел на покой в монастырь святого Иоанна Предтечи возле горы Меникион в Восточной Македонии. В обители Его трудами был возведен величественный храм в честь святого пророка Иоанна Крестителя.

В монастыре святитель Иоанн прожил до конца жизни и мирно отошел ко Господу в 1333 году. Его память отмечается 25 декабря.